국가/지역 미상 소프트웨어·인터넷 종료 사례 879369 실패 사례

Grid.org는 클러스터 컴퓨팅 및 그리드 컴퓨팅 소프트웨어 사용자를 위해 2001년에 설립된 웹사이트이자 온라인 커뮤니티입니다. 6년 동안 회원들이 여분의 컴퓨터 사이클을 가치 있는 목적에 기부할 수 있도록 하는 다양한 자원 봉사 컴퓨팅 프로젝트를 운영했습니다. 2007년에는 오픈 소스 클러스터와 그리드 컴퓨팅 소프트웨어를 위한 커뮤니티가 되었습니다. 2010년경 이후에는 다른 사이트로 리디렉션되었습니다.

자원봉사 컴퓨팅 프로젝트

2001년 4월 설립부터 2007년 4월 27일까지 Grid.org는 Jikku Venkat 박사가 이끄는 United Devices Cancer Research Project와 같은 분산 컴퓨팅 프로젝트를 실행하는 웹 사이트이자 조직이었습니다. United Devices(UD)의 자선 후원을 받았으며 회원들은 UD Agent 소프트웨어(버전 3.0)를 실행하여 자원 봉사 컴퓨팅에 참여했습니다.

암 연구 프로젝트

2001년에 시작된 United Devices 암 연구 프로젝트는 분산 컴퓨팅을 사용하여 암 치료를 위한 가능한 약물을 찾고 있었습니다. 미국에는 약 150,000명의 사용자가 있었고 유럽에는 170,000명이 있었으며 세계 다른 지역에는 수십만 명이 더 있었습니다.

이 프로젝트는 여러 회사와 조직의 연합이었습니다.

유나이티드 디바이스 주식회사

국립암연구재단

옥스퍼드대학교 화학과

분자 연구 기증자

United Devices는 여분의 컴퓨팅 성능을 사용한다는 원칙에 따라 암 연구 화면 보호기를 출시했습니다. 지속적으로 실행되도록 설정할 수 있는 이 프로그램은 분자와 표적 단백질(예: 약물) 사이의 가능한 상호 작용을 찾기 위해 "가상 스크리닝"을 사용했습니다. 이러한 분자(리간드)는 호스트 컴퓨터의 UD 에이전트로 전송됩니다. 이러한 분자가 표적 단백질과 성공적으로 도킹되면 추가 조사를 위해 이 상호 작용에 점수가 매겨집니다.

연구는 두 단계로 구성되었습니다.

1단계에서는 항암제의 적합한 표적으로 알려진 12가지 단백질에 대해 30억 개가 넘는 약물 유사 분자를 테스트했습니다. 분자 상호작용의 시뮬레이션을 위해 "THINK" 소프트웨어를 사용했습니다.

상호작용을 모델링하기 위해 Accelrys가 개발한 "LigandFit" 소프트웨어를 사용하는 2단계에서는 업계의 일부를 포함하여 실험적 협력자가 필요한 테스트를 위해 보다 관리하기 쉬운 약물 후보 목록을 생성하기 위해 1단계 데이터를 개선하려고 했습니다.

인간 단백질체 접기 프로젝트, 1단계

IBM이 후원하는 HPF(Human Proteome Folding Project) 1단계는 2004년 11월 16일에 발표되어 2006년 7월 3일에 완료되었습니다. 이 프로젝트는 Grid.org와 IBM의 World Community Grid에서 동시에 운영되었습니다.

단백질의 기능을 예측하는 데 도움을 주기 위해 "Rosetta" 소프트웨어를 사용하여 인간 단백질의 구조를 예측했습니다. 이 정보는 언젠가 다양한 질병과 유전적 결함을 치료하는 데 사용될 수 있습니다.

Grid.org 포럼의 발표에 따르면 HPF1 프로젝트는 완료된 후 2006년 8월 9일까지 계속해서 Grid.org에서 실행됩니다. 그 기간 동안 이 프로젝트를 실행하도록 컴퓨터가 구성된 구성원은 새로운 작업을 받고 컴퓨팅 리소스를 사용하여 결과를 계산했지만 결과는 포인트용으로만 Grid.org에 반환되었으며 과학 연구에는 사용되지 않았습니다.

인간 단백질체 접기 프로젝트(Human Proteome Folding Project)의 상태는 Grid.org 포럼에서 일부 토론을 불러일으켰습니다. 대부분의 회원은 여전히 ​​진행 중인 암 프로젝트에 사용 가능한 모든 컴퓨팅 성능을 보고 싶어했지만 UD 대표인 Robby Brewer는 "일부 [사용자]가 화면 보호기를 좋아한다"고 주장했습니다. 위에서 언급한 것처럼 결국 Grid.org의 중복 HPF1 작업이 중단되었습니다.

천연두 프로젝트

천연두 연구 그리드(Smallpox Research Grid)는 생물학적 테러리즘에 맞서 싸우기 위한 United Devices의 "Patriot Grid" 이니셔티브의 일부였습니다. 이 프로젝트는 천연두 바이러스 퇴치를 위한 의학적 치료법을 위한 잠재적인 약물 후보를 분석하는 데 도움이 되었습니다. 이는 이미 암 연구 프로젝트의 2단계에서 사용된 "LigandFit" 소프트웨어를 사용했지만 천연두 바이러스를 표적으로 삼는 특수한 표적 분자 세트를 사용했습니다.

이 프로젝트의 파트너에는 옥스퍼드 대학교, 웨스턴 온타리오 대학교, Memorial Sloan-Kettering 암 센터, Essex 대학교, Evotec OAI, Accelrys 및 IBM이 포함되었습니다.

World Community Grid는 주로 이 프로젝트의 성공으로 인해 시작되었습니다.

탄저병 프로젝트

탄저병 연구 프로젝트는 생물학적 테러리즘에 맞서 싸우기 위한 United Devices의 "Patriot Grid" 이니셔티브의 일부였습니다. 이는 "LigandFit" 소프트웨어(이미 암 연구 프로젝트의 2단계에서 사용됨)를 사용했지만 탄저병 박테리아 감염의 진행 단계를 표적으로 삼는 특수한 표적 분자 세트를 사용했습니다.

이 프로젝트는 2002년 1월 22일부터 2002년 2월 14일까지 진행되었으며 총 35억 7천만 개의 분자에 대한 스크리닝이 완료된 후 종료되었습니다. 연구 프로젝트의 결과는 전산 시뮬레이션 심사를 완료하기 위해 생물학자들에게 전달되었습니다.

이 프로젝트의 파트너에는 Oxford University가 포함되었습니다.

HMMER 프로젝트

HMMER 유전 연구 프로젝트는 유전적 DNA 서열의 패턴을 검색하기 위해 Hidden Markov 모델을 사용했습니다.

웹로드 프로젝트

웹 성능 테스트 프로젝트는 수요가 많은 기간에 서버 인프라의 확장성을 테스트하는 데 도움을 주기 위해 엄선된 웹 호스팅 제공업체와 상업적 기회로 운영되었습니다.

오픈 소스 그리드 커뮤니티

2007년 11월, Univa는 Grid.org를 사용자가 오픈 소스 클러스터 및 그리드 관련 주제와 상호 작용하고 토론할 수 있는 커뮤니티로 재배치했습니다. 이를 통해 사용자는 Univa에서 제공하는 오픈 소스 Globus Toolkit 기반 제품을 다운로드하고, 지원을 받고, 기여하고, 문제를 보고할 수 있었습니다.

2008년에는 100,000명이 넘는 고유 방문자가 보고되었습니다.

2010년 중반쯤에는 Unicluster.org(Univa 제품)로 리디렉션되었고 2012년에는 Univa의 기본 사이트로 리디렉션되었습니다.

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자원봉사 컴퓨팅 프로젝트 목록

참고자료